Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc17E9PVB5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms