Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc175E9PVB3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc175E9PVB3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms