Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifit3bE9PV48 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms