Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clca3bE9PUL3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Clca3bE9PUL3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms