Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Vpreb3D3Z6J4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Vpreb3D3Z6J4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms