Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms