Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm20521D3Z5F7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm20521D3Z5F7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms