Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rfx8D3YU81 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rfx8D3YU81 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rfx8D3YU81 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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