Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Phf11cB4XVP9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms