Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rd3lB2RV38 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms