Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zscan5bB2RTN3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zscan5bB2RTN3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms