Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf3B2KF05 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms