Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms