Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Otud3B1AZ99 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms