Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf25B1AWN9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf25B1AWN9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms