Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Spocd1B1ASB6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Spocd1B1ASB6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms