Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Grik3B1AS29 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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