Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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