Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Atp8b5A3FIN4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Atp8b5A3FIN4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Atp8b5A3FIN4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Atp8b5A3FIN4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Atp8b5A3FIN4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atp8b5A3FIN4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Atp8b5A3FIN4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Atp8b5A3FIN4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atp8b5A3FIN4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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