Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn3aA2ASI5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn3aA2ASI5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms