Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Patl2A2ARM1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Patl2A2ARM1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms