Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syndig1A2ANU3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms