Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lcn6A2AJB9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lcn6A2AJB9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms