Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc163A2AGD7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms