Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Frmpd4A2AFR3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Frmpd4A2AFR3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms