Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
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