Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms