Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2LB96

Trbv29, T cell receptor beta, variable 29 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv29A0A0G2LB96 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv29A0A0G2LB96 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv29A0A0G2LB96 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms