Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms