Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm5538W4VSP6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5538W4VSP6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm5538W4VSP6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gm5538W4VSP6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm5538W4VSP6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5538W4VSP6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms