Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r25W4VSP2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r25W4VSP2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms