Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Top3bQ9Z321 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Top3bQ9Z321 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms