Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gria3Q9Z2W9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria3Q9Z2W9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria3Q9Z2W9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria3Q9Z2W9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria3Q9Z2W9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria3Q9Z2W9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gria3Q9Z2W9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms