Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gria4Q9Z2W8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gria4Q9Z2W8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms