Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl40Q9Z2Q5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl40Q9Z2Q5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms