Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms