Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tulp1Q9Z273 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tulp1Q9Z273 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms