Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip6Q9Z1Y4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms