Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccl27Q9Z1X0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ccl27Q9Z1X0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccl27Q9Z1X0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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