Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms