Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lgr5Q9Z1P4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Lgr5Q9Z1P4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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Lgr5Q9Z1P4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Lgr5Q9Z1P4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Lgr5Q9Z1P4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lgr5Q9Z1P4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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