Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms