Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms