Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cog1Q9Z160 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cog1Q9Z160 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cog1Q9Z160 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cog1Q9Z160 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cog1Q9Z160 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cog1Q9Z160 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms