Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema4fQ9Z123 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema4fQ9Z123 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms