Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PapolbQ9WVP6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PapolbQ9WVP6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms