Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trpv2Q9WTR1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms