Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam50bQ9WTJ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms