Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PplQ9R269 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PplQ9R269 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PplQ9R269 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PplQ9R269 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PplQ9R269 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms