Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Y5

Hic1, Hypermethylated in cancer 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hic1Q9R1Y5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hic1Q9R1Y5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hic1Q9R1Y5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms